肿瘤细胞系STR检测
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信息概要
肿瘤细胞系STR检测是一种通过对短串联重复序列(Short Tandem Repeat, STR)进行分析,以鉴定和验证肿瘤细胞系身份与纯度的分子生物学检测服务。STR是基因组中高度多态性的DNA重复序列,其长度变异可用于区分不同细胞系。该检测对于确保实验研究的可靠性、可重复性以及防止细胞系交叉污染或误认至关重要。通过STR检测,可以有效评估细胞系的遗传稳定性,避免因使用错误或污染的细胞而导致科研数据偏差,广泛应用于生物医学研究、药物开发和临床诊断领域。
检测项目
基因座D5S818, 基因座D13S317, 基因座D7S820, 基因座D16S539, 基因座vWA, 基因座TH01, 基因座TPOX, 基因座CSF1PO, 基因座D3S1358, 基因座D8S1179, 基因座D21S11, 基因座D18S51, 基因座D2S1338, 基因座D19S433, 基因座FGA, 基因座Penta D, 基因座Penta E, 基因座D1S1656, 基因座D12S391, 基因座D2S441
检测范围
人类肿瘤细胞系, 小鼠肿瘤细胞系, 大鼠肿瘤细胞系, 乳腺癌细胞系, 肺癌细胞系, 结肠癌细胞系, 肝癌细胞系, 胃癌细胞系, 前列腺癌细胞系, 卵巢癌细胞系, 宫颈癌细胞系, 脑肿瘤细胞系, 白血病细胞系, 淋巴瘤细胞系, 黑色素瘤细胞系, 胰腺癌细胞系, 肾癌细胞系, 膀胱癌细胞系, 骨肉瘤细胞系, 神经母细胞瘤细胞系
检测方法
聚合酶链式反应(PCR)扩增法:通过特异性引物扩增STR位点,生成DNA片段用于分析。
毛细管电泳法:利用电泳分离扩增产物,根据片段大小进行STR分型。
荧光标记检测法:使用荧光染料标记STR引物,通过检测荧光信号确定基因型。
DNA提取与纯化法:从细胞样本中分离高质量DNA,确保检测准确性。
基因分型软件分析法:借助专业软件自动解读STR图谱,提高效率。
多重PCR技术:同时扩增多个STR位点,节省样本和时间。
Sanger测序验证法:对关键STR区域进行测序,确认分型结果。
实时荧光定量PCR法:定量评估STR扩增效率,用于质量控制。
微卫星不稳定性分析:检测STR位点的变异,评估细胞遗传稳定性。
DNA浓度与纯度测定法:使用分光光度计检测DNA样本质量。
细胞培养与传代法:制备标准细胞样本,确保检测代表性。
比对数据库法:将STR图谱与公共数据库对比,验证细胞系身份。
误差率评估法:分析检测过程中的随机误差,保证结果可靠性。
交叉污染检测法:通过STR差异识别样本间污染。
质量控制标准操作法:遵循国际指南(如ATCC标准),确保检测一致性。
检测仪器
PCR仪, 毛细管电泳仪, 荧光检测仪, DNA提取仪, 分光光度计, 凝胶成像系统, 实时荧光定量PCR仪, 测序仪, 微孔板读数器, 离心机, 恒温培养箱, 生物分析仪, 核酸定量仪, 自动液体处理系统, 显微镜
问:肿瘤细胞系STR检测的主要应用场景是什么?答:该检测主要用于科研实验室和制药公司,用于验证肿瘤细胞系的身份、纯度和遗传稳定性,防止实验误差。
问:STR检测如何帮助避免细胞系交叉污染?答:通过分析STR位点的独特图谱,可以识别不同细胞系间的差异,从而检测出潜在的污染或误认情况。
问:进行肿瘤细胞系STR检测需要多长时间?答:通常需要2-5个工作日,具体取决于样本数量、检测方法和实验室流程,包括DNA提取、扩增和数据分析步骤。