肠道菌群分析粪便16S rRNA测序

信息概要

肠道菌群分析粪便16S rRNA测序是一种通过高通量测序技术检测肠道微生物群落组成和功能的方法。该技术通过扩增和测序粪便样本中的16S rRNA基因片段，解析肠道菌群的多样性、丰度及结构特征。检测的重要性在于肠道菌群与人体健康密切相关，其失衡可能导致多种疾病，如肥胖、糖尿病、炎症性肠病等。通过该检测可评估肠道微生态状态，为疾病诊断、健康管理和个性化干预提供科学依据。

检测项目

Alpha多样性指数，Beta多样性分析，菌群丰度，菌群均匀度，优势菌群比例，稀有菌群比例，门水平分类，纲水平分类，目水平分类，科水平分类，属水平分类，种水平分类，功能预测分析，病原菌检测，益生菌检测，条件致病菌检测，菌群代谢通路分析，菌群与疾病关联分析，菌群稳定性评估，菌群耐药性分析

检测范围

健康人群肠道菌群检测，疾病患者肠道菌群检测，儿童肠道菌群检测，老年人肠道菌群检测，孕妇肠道菌群检测，肥胖人群肠道菌群检测，糖尿病患者肠道菌群检测，炎症性肠病患者肠道菌群检测，自闭症患者肠道菌群检测，过敏人群肠道菌群检测，抗生素使用后肠道菌群检测，益生菌干预后肠道菌群检测，饮食干预后肠道菌群检测，运动干预后肠道菌群检测，肠道菌群与心理健康关联检测，肠道菌群与免疫系统关联检测，肠道菌群与代谢疾病关联检测，肠道菌群与神经系统疾病关联检测，肠道菌群与心血管疾病关联检测，肠道菌群与癌症关联检测

检测方法

16S rRNA基因扩增：通过PCR扩增粪便样本中的16S rRNA基因片段。

高通量测序：使用Illumina等平台对扩增产物进行高通量测序。

序列质量控制：对原始测序数据进行质量过滤和修剪。

OTU聚类：将序列按相似度聚类为操作分类单元（OTU）。

物种注释：将OTU与数据库比对，注释物种分类信息。

Alpha多样性分析：计算样本内菌群多样性指数。

Beta多样性分析：比较样本间菌群组成差异。

LEfSe分析：识别不同组间显著差异的菌群。

PICRUSt功能预测：预测菌群代谢功能。

网络分析：构建菌群共生或竞争关系网络。

RDA分析：分析环境因子对菌群的影响。

机器学习模型：构建疾病预测模型。

qPCR验证：对关键菌群进行定量PCR验证。

宏基因组测序：辅助验证16S rRNA测序结果。

代谢组学分析：结合代谢物数据解析菌群功能。

检测仪器

Illumina MiSeq测序仪，Illumina NovaSeq测序仪，Qubit荧光定量仪，Nanodrop分光光度计，PCR仪，电泳仪，生物分析仪，离心机，超低温冰箱，恒温培养箱，自动化核酸提取仪，显微镜，酶标仪，实时荧光定量PCR仪，超纯水系统，生物安全柜

北检院部分仪器展示