多糖肠道菌群测序检测（16S rDNA α多样性）

信息概要

多糖肠道菌群测序检测（16S rDNA α多样性）是一种基于高通量测序技术的微生物群落分析方法，通过检测肠道菌群中16S rDNA基因的多样性，评估菌群结构的丰富度和均匀度。该检测对于研究肠道微生态平衡、疾病关联性、营养代谢及健康管理具有重要意义，可为个性化健康干预提供科学依据。

检测项目

Chao1指数，Shannon指数，Simpson指数，Observed species，PD whole tree，Faith’s PD，Pielou’s evenness，Good’s coverage，ACE指数，Bray-Curtis距离，Jaccard距离，Unweighted UniFrac距离，Weighted UniFrac距离，Beta多样性，Alpha多样性，菌群丰度，菌群均匀度，菌群组成，核心菌群分析，功能预测分析

检测范围

人类肠道菌群，动物肠道菌群，环境微生物，发酵食品菌群，益生菌制剂，抗生素干预菌群，疾病相关菌群，健康人群菌群，老年人群菌群，儿童肠道菌群，肥胖人群菌群，糖尿病相关菌群，炎症性肠病菌群，自闭症相关菌群，过敏人群菌群，代谢综合征菌群，肠道菌群移植样本，极端环境菌群，传统发酵菌群，基因编辑菌群

检测方法

16S rDNA扩增子测序：通过PCR扩增16S rDNA特定区域并进行高通量测序。

DNA提取：使用专用试剂盒从样本中提取微生物基因组DNA。

PCR扩增：针对16S rDNA的V3-V4区设计引物进行扩增。

文库构建：将扩增产物纯化后构建测序文库。

高通量测序：采用Illumina平台进行双端测序。

数据质控：对原始测序数据进行质量过滤和去噪。

OTU聚类：基于97%相似度对序列进行聚类。

物种注释：通过数据库比对进行菌群分类学分析。

多样性分析：计算Alpha和Beta多样性指数。

统计学分析：采用R语言或QIIME进行差异分析。

功能预测：使用PICRUSt或Tax4Fun预测菌群功能。

可视化分析：生成热图、PCA图等可视化结果。

生物信息学分析：挖掘菌群与表型的关联性。

机器学习建模：构建菌群标志物预测模型。

报告生成：整合分析结果形成标准化报告。

检测仪器

Illumina NovaSeq 6000，Illumina MiSeq，Qubit荧光定量仪，Nanodrop分光光度计，PCR仪，电泳仪，离心机，超净工作台，生物分析仪，冷冻离心机，恒温混匀仪，微量移液器，核酸提取仪，凝胶成像系统，超低温冰箱，生物安全柜

北检院部分仪器展示